Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FBXO39Q8N4B4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO39Q8N4B4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO39Q8N4B4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms