Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD302Q8IX05 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CD302Q8IX05 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD302Q8IX05 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms