Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM42Q8IWZ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM42Q8IWZ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM42Q8IWZ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM42Q8IWZ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM42Q8IWZ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM42Q8IWZ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM42Q8IWZ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM42Q8IWZ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM42Q8IWZ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms