Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTU1Q7Z7A3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CTU1Q7Z7A3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTU1Q7Z7A3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTU1Q7Z7A3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CTU1Q7Z7A3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CTU1Q7Z7A3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTU1Q7Z7A3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTU1Q7Z7A3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTU1Q7Z7A3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTU1Q7Z7A3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTU1Q7Z7A3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTU1Q7Z7A3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTU1Q7Z7A3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CTU1Q7Z7A3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms