Protein–RNA interactions for Protein: Q76KD6

SPATC1, Speriolin, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATC1Q76KD6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPATC1Q76KD6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPATC1Q76KD6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATC1Q76KD6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATC1Q76KD6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATC1Q76KD6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATC1Q76KD6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATC1Q76KD6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATC1Q76KD6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATC1Q76KD6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms