Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms