Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
XIRP1Q702N8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
XIRP1Q702N8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
XIRP1Q702N8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.38■■■■□ 3.42
XIRP1Q702N8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
XIRP1Q702N8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms