Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNT2Q6UVM3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNT2Q6UVM3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNT2Q6UVM3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNT2Q6UVM3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNT2Q6UVM3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms