Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFWD3Q6PCD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFWD3Q6PCD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFWD3Q6PCD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.1 ms