Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SUMO4Q6EEV6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUMO4Q6EEV6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms