Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACHD1Q5VU97 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACHD1Q5VU97 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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