Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF220Q5VTB9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF220Q5VTB9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF220Q5VTB9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF220Q5VTB9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF220Q5VTB9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms