Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CT47A1Q5JQC4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47A1Q5JQC4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47A1Q5JQC4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms