Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC38Q502W7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC38Q502W7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC38Q502W7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC38Q502W7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms