Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRIT3Q3SXY7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRIT3Q3SXY7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRIT3Q3SXY7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRIT3Q3SXY7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRIT3Q3SXY7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRIT3Q3SXY7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRIT3Q3SXY7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRIT3Q3SXY7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms