Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP13-4Q3LI77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP13-4Q3LI77 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP13-4Q3LI77 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP13-4Q3LI77 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP13-4Q3LI77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP13-4Q3LI77 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP13-4Q3LI77 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP13-4Q3LI77 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms