Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCN1Q15293 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCN1Q15293 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCN1Q15293 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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