Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAM2Q15035 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM2Q15035 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAM2Q15035 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM2Q15035 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195 ms