Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.249e-8■■■■■ 59.6
PABPC4Q13310 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 59.4
PABPC4Q13310 OSBP2-212ENST00000452656 2763 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.243e-17■■■■■ 59.3
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PABPC4Q13310 SLC50A1-210ENST00000488609 890 ntTSL 319.27■□□□□ 0.682e-17■■■■■ 59.3
PABPC4Q13310 SLC50A1-212ENST00000490770 991 ntTSL 312.78□□□□□ -0.362e-17■■■■■ 59.3
PABPC4Q13310 LAMTOR4-211ENST00000490633 401 ntTSL 317.14■□□□□ 0.339e-17■■■■■ 59.1
PABPC4Q13310 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.91□□□□□ -1.465e-9■■■■■ 59.1
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PABPC4Q13310 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 59
PABPC4Q13310 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 59
PABPC4Q13310 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 59
PABPC4Q13310 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-323■■■■■ 58.9
PABPC4Q13310 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 213.33□□□□□ -0.281e-323■■■■■ 58.9
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PABPC4Q13310 STXBP1-214ENST00000635950 2771 ntTSL 522.18■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-217ENST00000637060 3825 ntTSL 514.58□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-219ENST00000637464 4893 ntTSL 513.51□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-218ENST00000637173 4193 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-209ENST00000626539 3840 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-215ENST00000636509 3949 ntTSL 511.47□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-212ENST00000628768 2582 nt11□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 STXBP1-208ENST00000626416 3700 ntTSL 57.2□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.199e-8■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.079e-8■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.869e-8■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 ST6GALNAC6-212ENST00000485320 2357 ntTSL 523.25■■□□□ 1.319e-8■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.229e-8■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.779e-8■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.549e-8■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.479e-8■■■■■ 58.7
PABPC4Q13310 MESD-202ENST00000422879 1392 ntTSL 220.06■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 58.5
PABPC4Q13310 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 58.5
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PABPC4Q13310 MESD-207ENST00000619987 3978 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 58.5
PABPC4Q13310 MESD-204ENST00000560189 936 ntTSL 512.11□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 58.5
PABPC4Q13310 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.056e-7■■■■■ 58.4
PABPC4Q13310 FAM122C-206ENST00000470657 783 ntTSL 510.89□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 58.4
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PABPC4Q13310 FAM122C-207ENST00000475361 2483 ntTSL 29.57□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 58.4
PABPC4Q13310 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 58.4
PABPC4Q13310 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -16e-7■■■■■ 58.4
PABPC4Q13310 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 58.4
PABPC4Q13310 FAM122C-208ENST00000482240 665 ntTSL 37.25□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 58.4
PABPC4Q13310 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 58
PABPC4Q13310 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.396e-28■■■■■ 58
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PABPC4Q13310 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.972e-31■■■■■ 57.9
PABPC4Q13310 HBA2-202ENST00000397806 513 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-31■■■■■ 57.9
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PABPC4Q13310 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.945e-13■■■■■ 57.8
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PABPC4Q13310 ANGPT1-202ENST00000517746 4322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best)3.35□□□□□ -1.873e-7■■■■■ 57.6
PABPC4Q13310 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.952e-20■■■■■ 57.5
PABPC4Q13310 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.479e-7■■■■■ 57.5
PABPC4Q13310 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.123e-18■■■■■ 57.4
PABPC4Q13310 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.893e-18■■■■■ 57.4
PABPC4Q13310 UAP1-202ENST00000367924 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.823e-18■■■■■ 57.4
PABPC4Q13310 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.073e-18■■■■■ 57.4
PABPC4Q13310 UAP1-207ENST00000486089 1147 ntTSL 27.86□□□□□ -1.153e-18■■■■■ 57.4
PABPC4Q13310 PABPC1-205ENST00000518196 631 ntTSL 315.18■□□□□ 0.021e-323■■■■■ 57.3
PABPC4Q13310 PABPC1-221ENST00000522720 593 ntTSL 419.62■□□□□ 0.731e-323■■■■■ 57.1
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PABPC4Q13310 KLHDC2-208ENST00000555739 1696 ntTSL 522.67■■□□□ 1.223e-13■■■■■ 56.9
PABPC4Q13310 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.033e-13■■■■■ 56.9
PABPC4Q13310 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-13■■■■■ 56.9
PABPC4Q13310 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.023e-13■■■■■ 56.9
PABPC4Q13310 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-23■■■■■ 56.8
PABPC4Q13310 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.063e-23■■■■■ 56.8
PABPC4Q13310 SARS-203ENST00000468588 1582 ntTSL 25.93□□□□□ -1.463e-23■■■■■ 56.8
PABPC4Q13310 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.525e-28■■■■■ 56.6
PABPC4Q13310 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.631e-16■■■■■ 56.6
PABPC4Q13310 PRPF19-202ENST00000535326 779 ntTSL 514.33□□□□□ -0.121e-16■■■■■ 56.6
PABPC4Q13310 PRPF19-205ENST00000540473 169 ntTSL 58□□□□□ -1.131e-16■■■■■ 56.6
PABPC4Q13310 AC131235.1-201ENST00000433853 732 ntBASIC12.37□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 56.5
PABPC4Q13310 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 12e-11■■■■■ 56.3
PABPC4Q13310 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.465e-17■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.074e-12■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.561e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 MXD3-206ENST00000503782 1854 ntTSL 230.85■■■□□ 2.531e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.311e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 MXD3-207ENST00000509339 579 ntTSL 329.1■■■□□ 2.251e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.221e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.081e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ARHGAP4-210ENST00000442172 880 ntTSL 325.84■■□□□ 1.731e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ARHGAP4-212ENST00000454164 747 ntTSL 525.07■■□□□ 1.61e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.581e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ARHGAP4-215ENST00000461739 614 ntTSL 324.7■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 56.2
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 658.4 ms