RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555739.5

KLHDC2-208, Transcript of kelch domain containing 2, human

TSL 5

Gene KLHDC2, Length 1,696 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLHDC2-208	ENST00000555739	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.69	■■■■■ 4.91
KLHDC2-208	ENST00000555739	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.95	■■■■□ 3.99
KLHDC2-208	ENST00000555739	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.34	■■■■□ 3.73
KLHDC2-208	ENST00000555739	ABCC9	O60706	1549 aa		37.89	■■■■□ 3.66
KLHDC2-208	ENST00000555739	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.84	■■■■□ 3.65
KLHDC2-208	ENST00000555739	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.81	■■■■□ 3.64
KLHDC2-208	ENST00000555739	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.48	■■■■□ 3.59
KLHDC2-208	ENST00000555739	NACAD	O15069	1562 aa		37.29	■■■■□ 3.56
KLHDC2-208	ENST00000555739	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37.07	■■■■□ 3.52
KLHDC2-208	ENST00000555739	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37	■■■■□ 3.51
KLHDC2-208	ENST00000555739	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.64	■■■■□ 3.46
KLHDC2-208	ENST00000555739	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.1	■■■■□ 3.37
KLHDC2-208	ENST00000555739	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.78	■■■■□ 3.32
KLHDC2-208	ENST00000555739	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.69	■■■■□ 3.3
KLHDC2-208	ENST00000555739	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.64	■■■■□ 3.3
KLHDC2-208	ENST00000555739	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.45	■■■■□ 3.27
KLHDC2-208	ENST00000555739	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.37	■■■■□ 3.25
KLHDC2-208	ENST00000555739	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.33	■■■■□ 3.25
KLHDC2-208	ENST00000555739	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.25	■■■■□ 3.23
KLHDC2-208	ENST00000555739	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.14	■■■■□ 3.22
KLHDC2-208	ENST00000555739	WIZ	O95785	1651 aa		34.93	■■■■□ 3.18
KLHDC2-208	ENST00000555739	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.77	■■■■□ 3.16
KLHDC2-208	ENST00000555739	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.75	■■■■□ 3.15
KLHDC2-208	ENST00000555739	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.66	■■■■□ 3.14
KLHDC2-208	ENST00000555739	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.64	■■■■□ 3.14
KLHDC2-208	ENST00000555739	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.64	■■■■□ 3.14
KLHDC2-208	ENST00000555739	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.45	■■■■□ 3.11
KLHDC2-208	ENST00000555739	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.41	■■■■□ 3.1
KLHDC2-208	ENST00000555739	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.33	■■■■□ 3.09
KLHDC2-208	ENST00000555739	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.29	■■■■□ 3.08
KLHDC2-208	ENST00000555739	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.25	■■■■□ 3.07
KLHDC2-208	ENST00000555739	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		34.02	■■■■□ 3.04
KLHDC2-208	ENST00000555739	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.78	■■■■□ 3
KLHDC2-208	ENST00000555739	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.59	■■■□□ 2.97
KLHDC2-208	ENST00000555739	CFTR	P13569	1480 aa		33.58	■■■□□ 2.97
KLHDC2-208	ENST00000555739	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.51	■■■□□ 2.96
KLHDC2-208	ENST00000555739	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.42	■■■□□ 2.94
KLHDC2-208	ENST00000555739	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.35	■■■□□ 2.93
KLHDC2-208	ENST00000555739	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.33	■■■□□ 2.93
KLHDC2-208	ENST00000555739	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.27	■■■□□ 2.92
KLHDC2-208	ENST00000555739	NES	P48681	1621 aa		33.17	■■■□□ 2.9
KLHDC2-208	ENST00000555739	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.12	■■■□□ 2.89
KLHDC2-208	ENST00000555739	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.11	■■■□□ 2.89
KLHDC2-208	ENST00000555739	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.06	■■■□□ 2.88
KLHDC2-208	ENST00000555739	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.05	■■■□□ 2.88
KLHDC2-208	ENST00000555739	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33.01	■■■□□ 2.87
KLHDC2-208	ENST00000555739	CUX1	P39880	1505 aa		32.98	■■■□□ 2.87
KLHDC2-208	ENST00000555739	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.95	■■■□□ 2.87
KLHDC2-208	ENST00000555739	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
KLHDC2-208	ENST00000555739	EEA1	Q15075	1411 aa		32.83	■■■□□ 2.85
KLHDC2-208	ENST00000555739	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.79	■■■□□ 2.84
KLHDC2-208	ENST00000555739	SOGA1	O94964	1423 aa		32.79	■■■□□ 2.84
KLHDC2-208	ENST00000555739	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.76	■■■□□ 2.83
KLHDC2-208	ENST00000555739	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.72	■■■□□ 2.83
KLHDC2-208	ENST00000555739	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.68	■■■□□ 2.82
KLHDC2-208	ENST00000555739	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
KLHDC2-208	ENST00000555739	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.66	■■■□□ 2.82
KLHDC2-208	ENST00000555739	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.64	■■■□□ 2.81
KLHDC2-208	ENST00000555739	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.63	■■■□□ 2.81
KLHDC2-208	ENST00000555739	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.6	■■■□□ 2.81
KLHDC2-208	ENST00000555739	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.58	■■■□□ 2.81
KLHDC2-208	ENST00000555739	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.55	■■■□□ 2.8
KLHDC2-208	ENST00000555739	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
KLHDC2-208	ENST00000555739	CUX2	O14529	1486 aa		32.45	■■■□□ 2.79
KLHDC2-208	ENST00000555739	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KLHDC2-208	ENST00000555739	WDR62	O43379	1518 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KLHDC2-208	ENST00000555739	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KLHDC2-208	ENST00000555739	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.37	■■■□□ 2.77
KLHDC2-208	ENST00000555739	KIF21B	O75037	1637 aa		32.33	■■■□□ 2.77
KLHDC2-208	ENST00000555739	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.31	■■■□□ 2.76
KLHDC2-208	ENST00000555739	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
KLHDC2-208	ENST00000555739	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.25	■■■□□ 2.75
KLHDC2-208	ENST00000555739	IGF1R	P08069	1367 aa		32.23	■■■□□ 2.75
KLHDC2-208	ENST00000555739	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.23	■■■□□ 2.75
KLHDC2-208	ENST00000555739	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
KLHDC2-208	ENST00000555739	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.74
KLHDC2-208	ENST00000555739	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.19	■■■□□ 2.74
KLHDC2-208	ENST00000555739	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.19	■■■□□ 2.74
KLHDC2-208	ENST00000555739	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.18	■■■□□ 2.74
KLHDC2-208	ENST00000555739	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.14	■■■□□ 2.74
KLHDC2-208	ENST00000555739	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
KLHDC2-208	ENST00000555739	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.12	■■■□□ 2.73
KLHDC2-208	ENST00000555739	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.12	■■■□□ 2.73
KLHDC2-208	ENST00000555739	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.09	■■■□□ 2.73
KLHDC2-208	ENST00000555739	CUL7	Q14999	1698 aa		32.01	■■■□□ 2.72
KLHDC2-208	ENST00000555739	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.96	■■■□□ 2.71
KLHDC2-208	ENST00000555739	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.95	■■■□□ 2.71	4e-6	■■■■■ 31
KLHDC2-208	ENST00000555739	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
KLHDC2-208	ENST00000555739	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.91	■■■□□ 2.7
KLHDC2-208	ENST00000555739	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.88	■■■□□ 2.69
KLHDC2-208	ENST00000555739	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
KLHDC2-208	ENST00000555739	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.79	■■■□□ 2.68
KLHDC2-208	ENST00000555739	CLIP1	P30622	1438 aa		31.78	■■■□□ 2.68
KLHDC2-208	ENST00000555739	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.72	■■■□□ 2.67
KLHDC2-208	ENST00000555739	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.67	■■■□□ 2.66
KLHDC2-208	ENST00000555739	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
KLHDC2-208	ENST00000555739	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.65
KLHDC2-208	ENST00000555739	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		31.58	■■■□□ 2.65
KLHDC2-208	ENST00000555739	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.53	■■■□□ 2.64
KLHDC2-208	ENST00000555739	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms