Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NFIAQ12857 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NFIAQ12857 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFIAQ12857 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
NFIAQ12857 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NFIAQ12857 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFIAQ12857 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
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