Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNB2Q03252 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB2Q03252 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB2Q03252 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB2Q03252 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms