Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DSG1Q02413 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DSG1Q02413 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DSG1Q02413 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DSG1Q02413 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DSG1Q02413 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DSG1Q02413 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DSG1Q02413 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DSG1Q02413 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DSG1Q02413 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DSG1Q02413 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DSG1Q02413 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DSG1Q02413 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DSG1Q02413 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DSG1Q02413 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DSG1Q02413 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DSG1Q02413 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DSG1Q02413 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DSG1Q02413 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DSG1Q02413 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DSG1Q02413 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DSG1Q02413 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DSG1Q02413 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSG1Q02413 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSG1Q02413 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG1Q02413 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms