Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC5Q00444 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC5Q00444 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC5Q00444 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC5Q00444 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms