Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKP1P63208 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKP1P63208 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKP1P63208 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKP1P63208 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKP1P63208 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKP1P63208 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKP1P63208 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKP1P63208 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKP1P63208 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKP1P63208 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKP1P63208 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKP1P63208 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKP1P63208 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SKP1P63208 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKP1P63208 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKP1P63208 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKP1P63208 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKP1P63208 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKP1P63208 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKP1P63208 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKP1P63208 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKP1P63208 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKP1P63208 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKP1P63208 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKP1P63208 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKP1P63208 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKP1P63208 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKP1P63208 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKP1P63208 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKP1P63208 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKP1P63208 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKP1P63208 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKP1P63208 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKP1P63208 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKP1P63208 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKP1P63208 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKP1P63208 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKP1P63208 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKP1P63208 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKP1P63208 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKP1P63208 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKP1P63208 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKP1P63208 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKP1P63208 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKP1P63208 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKP1P63208 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKP1P63208 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKP1P63208 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKP1P63208 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKP1P63208 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKP1P63208 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKP1P63208 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKP1P63208 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKP1P63208 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKP1P63208 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKP1P63208 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKP1P63208 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKP1P63208 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKP1P63208 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKP1P63208 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKP1P63208 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKP1P63208 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKP1P63208 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKP1P63208 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKP1P63208 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKP1P63208 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKP1P63208 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SKP1P63208 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKP1P63208 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKP1P63208 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKP1P63208 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKP1P63208 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKP1P63208 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKP1P63208 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKP1P63208 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKP1P63208 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKP1P63208 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKP1P63208 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKP1P63208 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKP1P63208 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKP1P63208 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKP1P63208 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SKP1P63208 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SKP1P63208 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKP1P63208 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKP1P63208 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKP1P63208 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKP1P63208 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKP1P63208 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKP1P63208 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKP1P63208 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKP1P63208 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKP1P63208 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKP1P63208 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKP1P63208 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKP1P63208 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKP1P63208 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SKP1P63208 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKP1P63208 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms