Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNA4P52798 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA4P52798 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA4P52798 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms