Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR8P51685 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR8P51685 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR8P51685 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR8P51685 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR8P51685 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR8P51685 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR8P51685 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR8P51685 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR8P51685 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR8P51685 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR8P51685 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR8P51685 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR8P51685 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR8P51685 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR8P51685 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR8P51685 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR8P51685 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR8P51685 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR8P51685 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR8P51685 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR8P51685 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR8P51685 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR8P51685 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR8P51685 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR8P51685 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR8P51685 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR8P51685 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR8P51685 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR8P51685 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR8P51685 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR8P51685 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR8P51685 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR8P51685 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR8P51685 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR8P51685 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR8P51685 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR8P51685 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR8P51685 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR8P51685 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR8P51685 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR8P51685 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR8P51685 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR8P51685 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR8P51685 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR8P51685 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR8P51685 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR8P51685 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR8P51685 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR8P51685 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR8P51685 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCR8P51685 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR8P51685 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR8P51685 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR8P51685 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR8P51685 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR8P51685 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR8P51685 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR8P51685 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR8P51685 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR8P51685 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR8P51685 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR8P51685 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR8P51685 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR8P51685 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR8P51685 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR8P51685 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR8P51685 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR8P51685 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR8P51685 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR8P51685 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR8P51685 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR8P51685 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR8P51685 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR8P51685 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR8P51685 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR8P51685 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR8P51685 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR8P51685 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR8P51685 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR8P51685 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR8P51685 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR8P51685 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR8P51685 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR8P51685 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR8P51685 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR8P51685 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR8P51685 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR8P51685 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR8P51685 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR8P51685 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR8P51685 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR8P51685 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR8P51685 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR8P51685 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR8P51685 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR8P51685 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR8P51685 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR8P51685 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR8P51685 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms