Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL1P50553 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL1P50553 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL1P50553 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL1P50553 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms