Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDI2P50395 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDI2P50395 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDI2P50395 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GDI2P50395 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDI2P50395 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDI2P50395 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDI2P50395 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDI2P50395 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDI2P50395 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDI2P50395 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDI2P50395 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDI2P50395 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDI2P50395 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDI2P50395 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDI2P50395 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDI2P50395 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDI2P50395 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDI2P50395 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GDI2P50395 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDI2P50395 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDI2P50395 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDI2P50395 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDI2P50395 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDI2P50395 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDI2P50395 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDI2P50395 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDI2P50395 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDI2P50395 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDI2P50395 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDI2P50395 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDI2P50395 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDI2P50395 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDI2P50395 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDI2P50395 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDI2P50395 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDI2P50395 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDI2P50395 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDI2P50395 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDI2P50395 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDI2P50395 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDI2P50395 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDI2P50395 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDI2P50395 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDI2P50395 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDI2P50395 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDI2P50395 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDI2P50395 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDI2P50395 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDI2P50395 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDI2P50395 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDI2P50395 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDI2P50395 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDI2P50395 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDI2P50395 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDI2P50395 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDI2P50395 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDI2P50395 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDI2P50395 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDI2P50395 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDI2P50395 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDI2P50395 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDI2P50395 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDI2P50395 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDI2P50395 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDI2P50395 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDI2P50395 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDI2P50395 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDI2P50395 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDI2P50395 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDI2P50395 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDI2P50395 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDI2P50395 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDI2P50395 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDI2P50395 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDI2P50395 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GDI2P50395 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDI2P50395 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDI2P50395 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDI2P50395 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDI2P50395 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDI2P50395 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDI2P50395 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDI2P50395 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDI2P50395 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDI2P50395 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDI2P50395 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDI2P50395 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDI2P50395 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDI2P50395 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDI2P50395 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDI2P50395 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDI2P50395 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDI2P50395 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDI2P50395 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDI2P50395 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDI2P50395 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDI2P50395 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDI2P50395 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDI2P50395 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms