Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPFP49454 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPFP49454 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPFP49454 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPFP49454 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPFP49454 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPFP49454 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPFP49454 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPFP49454 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPFP49454 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPFP49454 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPFP49454 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPFP49454 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPFP49454 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPFP49454 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPFP49454 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPFP49454 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPFP49454 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPFP49454 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPFP49454 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPFP49454 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPFP49454 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPFP49454 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPFP49454 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPFP49454 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPFP49454 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPFP49454 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPFP49454 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPFP49454 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPFP49454 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CENPFP49454 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CENPFP49454 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPFP49454 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPFP49454 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPFP49454 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPFP49454 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPFP49454 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPFP49454 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPFP49454 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPFP49454 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPFP49454 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPFP49454 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPFP49454 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPFP49454 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPFP49454 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPFP49454 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPFP49454 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPFP49454 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPFP49454 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPFP49454 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPFP49454 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPFP49454 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPFP49454 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPFP49454 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPFP49454 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPFP49454 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPFP49454 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPFP49454 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPFP49454 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPFP49454 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPFP49454 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPFP49454 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPFP49454 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPFP49454 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPFP49454 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPFP49454 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPFP49454 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPFP49454 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPFP49454 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPFP49454 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPFP49454 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPFP49454 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CENPFP49454 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPFP49454 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPFP49454 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPFP49454 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPFP49454 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPFP49454 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPFP49454 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPFP49454 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPFP49454 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPFP49454 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPFP49454 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPFP49454 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPFP49454 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPFP49454 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPFP49454 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPFP49454 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPFP49454 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPFP49454 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPFP49454 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPFP49454 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPFP49454 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPFP49454 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPFP49454 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPFP49454 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPFP49454 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPFP49454 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPFP49454 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPFP49454 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms