Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSFMP43897 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSFMP43897 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSFMP43897 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSFMP43897 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSFMP43897 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSFMP43897 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSFMP43897 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSFMP43897 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSFMP43897 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSFMP43897 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSFMP43897 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSFMP43897 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSFMP43897 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSFMP43897 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSFMP43897 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSFMP43897 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSFMP43897 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSFMP43897 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSFMP43897 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSFMP43897 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSFMP43897 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSFMP43897 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSFMP43897 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSFMP43897 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSFMP43897 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSFMP43897 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSFMP43897 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSFMP43897 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSFMP43897 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSFMP43897 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSFMP43897 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSFMP43897 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSFMP43897 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSFMP43897 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSFMP43897 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSFMP43897 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSFMP43897 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSFMP43897 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSFMP43897 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSFMP43897 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSFMP43897 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSFMP43897 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSFMP43897 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSFMP43897 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSFMP43897 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSFMP43897 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSFMP43897 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSFMP43897 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSFMP43897 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSFMP43897 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSFMP43897 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSFMP43897 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSFMP43897 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSFMP43897 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSFMP43897 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSFMP43897 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSFMP43897 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSFMP43897 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSFMP43897 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSFMP43897 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSFMP43897 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSFMP43897 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSFMP43897 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSFMP43897 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSFMP43897 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSFMP43897 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSFMP43897 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSFMP43897 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSFMP43897 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSFMP43897 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSFMP43897 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSFMP43897 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSFMP43897 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSFMP43897 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSFMP43897 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSFMP43897 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSFMP43897 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSFMP43897 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSFMP43897 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSFMP43897 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSFMP43897 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSFMP43897 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSFMP43897 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSFMP43897 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSFMP43897 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSFMP43897 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSFMP43897 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSFMP43897 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSFMP43897 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSFMP43897 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSFMP43897 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSFMP43897 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSFMP43897 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSFMP43897 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSFMP43897 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSFMP43897 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSFMP43897 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSFMP43897 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSFMP43897 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms