Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT9P35527 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT9P35527 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT9P35527 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT9P35527 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT9P35527 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT9P35527 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT9P35527 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT9P35527 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT9P35527 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT9P35527 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT9P35527 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT9P35527 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT9P35527 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT9P35527 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT9P35527 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT9P35527 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT9P35527 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT9P35527 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT9P35527 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT9P35527 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT9P35527 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT9P35527 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT9P35527 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT9P35527 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT9P35527 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT9P35527 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT9P35527 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT9P35527 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT9P35527 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT9P35527 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT9P35527 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT9P35527 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT9P35527 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT9P35527 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT9P35527 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT9P35527 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT9P35527 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT9P35527 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT9P35527 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT9P35527 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT9P35527 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT9P35527 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT9P35527 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT9P35527 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT9P35527 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT9P35527 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT9P35527 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT9P35527 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT9P35527 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT9P35527 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT9P35527 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT9P35527 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT9P35527 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT9P35527 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT9P35527 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT9P35527 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT9P35527 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT9P35527 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT9P35527 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT9P35527 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT9P35527 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT9P35527 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT9P35527 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT9P35527 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT9P35527 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT9P35527 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT9P35527 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT9P35527 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT9P35527 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT9P35527 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT9P35527 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT9P35527 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT9P35527 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT9P35527 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT9P35527 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT9P35527 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT9P35527 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT9P35527 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT9P35527 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT9P35527 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT9P35527 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT9P35527 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT9P35527 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT9P35527 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT9P35527 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT9P35527 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT9P35527 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT9P35527 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT9P35527 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT9P35527 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT9P35527 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT9P35527 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT9P35527 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT9P35527 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT9P35527 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT9P35527 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT9P35527 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT9P35527 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT9P35527 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.8 ms