Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CASQ1P31415 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASQ1P31415 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASQ1P31415 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASQ1P31415 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CASQ1P31415 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASQ1P31415 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms