Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHATP28329 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHATP28329 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHATP28329 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHATP28329 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHATP28329 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHATP28329 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHATP28329 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHATP28329 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHATP28329 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHATP28329 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHATP28329 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHATP28329 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHATP28329 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHATP28329 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHATP28329 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHATP28329 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHATP28329 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHATP28329 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHATP28329 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHATP28329 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHATP28329 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHATP28329 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHATP28329 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHATP28329 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHATP28329 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHATP28329 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHATP28329 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHATP28329 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHATP28329 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHATP28329 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHATP28329 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHATP28329 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHATP28329 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHATP28329 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHATP28329 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHATP28329 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHATP28329 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHATP28329 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHATP28329 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHATP28329 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHATP28329 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHATP28329 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHATP28329 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHATP28329 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHATP28329 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHATP28329 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHATP28329 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHATP28329 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHATP28329 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHATP28329 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHATP28329 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHATP28329 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHATP28329 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHATP28329 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHATP28329 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHATP28329 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHATP28329 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHATP28329 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHATP28329 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHATP28329 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHATP28329 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHATP28329 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHATP28329 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHATP28329 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHATP28329 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHATP28329 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHATP28329 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHATP28329 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHATP28329 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHATP28329 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHATP28329 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHATP28329 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHATP28329 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHATP28329 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHATP28329 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHATP28329 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHATP28329 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHATP28329 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHATP28329 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHATP28329 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHATP28329 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHATP28329 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHATP28329 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHATP28329 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHATP28329 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHATP28329 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHATP28329 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHATP28329 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHATP28329 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHATP28329 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHATP28329 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHATP28329 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHATP28329 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHATP28329 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHATP28329 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHATP28329 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHATP28329 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHATP28329 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHATP28329 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms