Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX1P27695 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX1P27695 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX1P27695 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX1P27695 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX1P27695 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX1P27695 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX1P27695 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX1P27695 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX1P27695 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX1P27695 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX1P27695 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX1P27695 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX1P27695 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX1P27695 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX1P27695 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX1P27695 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX1P27695 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX1P27695 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX1P27695 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX1P27695 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX1P27695 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX1P27695 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX1P27695 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APEX1P27695 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX1P27695 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX1P27695 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX1P27695 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX1P27695 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX1P27695 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APEX1P27695 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX1P27695 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX1P27695 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX1P27695 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX1P27695 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APEX1P27695 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX1P27695 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX1P27695 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX1P27695 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APEX1P27695 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APEX1P27695 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX1P27695 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APEX1P27695 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX1P27695 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX1P27695 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APEX1P27695 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX1P27695 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX1P27695 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX1P27695 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX1P27695 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX1P27695 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX1P27695 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX1P27695 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX1P27695 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX1P27695 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APEX1P27695 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APEX1P27695 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APEX1P27695 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APEX1P27695 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APEX1P27695 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APEX1P27695 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX1P27695 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX1P27695 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX1P27695 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APEX1P27695 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX1P27695 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX1P27695 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APEX1P27695 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APEX1P27695 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX1P27695 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX1P27695 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX1P27695 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX1P27695 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX1P27695 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX1P27695 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APEX1P27695 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX1P27695 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX1P27695 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX1P27695 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX1P27695 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX1P27695 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX1P27695 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX1P27695 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX1P27695 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX1P27695 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX1P27695 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX1P27695 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX1P27695 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX1P27695 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX1P27695 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX1P27695 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX1P27695 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX1P27695 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX1P27695 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX1P27695 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX1P27695 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX1P27695 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX1P27695 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX1P27695 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX1P27695 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms