Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
IL3RAP26951 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IL3RAP26951 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms