Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMB1P20618 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB1P20618 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB1P20618 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms