Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF1BP20333 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFRSF1BP20333 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF1BP20333 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF1BP20333 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF1BP20333 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF1BP20333 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF1BP20333 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF1BP20333 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms