Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM21P19474 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM21P19474 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM21P19474 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms