Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE6GP18545 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6GP18545 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6GP18545 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6GP18545 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms