Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPI1P17947 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPI1P17947 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPI1P17947 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPI1P17947 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPI1P17947 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPI1P17947 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPI1P17947 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPI1P17947 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPI1P17947 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPI1P17947 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPI1P17947 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPI1P17947 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPI1P17947 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPI1P17947 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPI1P17947 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPI1P17947 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPI1P17947 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPI1P17947 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPI1P17947 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPI1P17947 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPI1P17947 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPI1P17947 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPI1P17947 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPI1P17947 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPI1P17947 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPI1P17947 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPI1P17947 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPI1P17947 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPI1P17947 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPI1P17947 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPI1P17947 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPI1P17947 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPI1P17947 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPI1P17947 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPI1P17947 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPI1P17947 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPI1P17947 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPI1P17947 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPI1P17947 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPI1P17947 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPI1P17947 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPI1P17947 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPI1P17947 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPI1P17947 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPI1P17947 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPI1P17947 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPI1P17947 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPI1P17947 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPI1P17947 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPI1P17947 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPI1P17947 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPI1P17947 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPI1P17947 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPI1P17947 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPI1P17947 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPI1P17947 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPI1P17947 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPI1P17947 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPI1P17947 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPI1P17947 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPI1P17947 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPI1P17947 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPI1P17947 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPI1P17947 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPI1P17947 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPI1P17947 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPI1P17947 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPI1P17947 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPI1P17947 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPI1P17947 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPI1P17947 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPI1P17947 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPI1P17947 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPI1P17947 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPI1P17947 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPI1P17947 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPI1P17947 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPI1P17947 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPI1P17947 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPI1P17947 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPI1P17947 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPI1P17947 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPI1P17947 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPI1P17947 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPI1P17947 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPI1P17947 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPI1P17947 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPI1P17947 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPI1P17947 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPI1P17947 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPI1P17947 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPI1P17947 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPI1P17947 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPI1P17947 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPI1P17947 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPI1P17947 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPI1P17947 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPI1P17947 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPI1P17947 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms