Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRP12270 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRP12270 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRP12270 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRP12270 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRP12270 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRP12270 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRP12270 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRP12270 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRP12270 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRP12270 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRP12270 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRP12270 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRP12270 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRP12270 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRP12270 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRP12270 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRP12270 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRP12270 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRP12270 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRP12270 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRP12270 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRP12270 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRP12270 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRP12270 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRP12270 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRP12270 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPRP12270 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPRP12270 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRP12270 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRP12270 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRP12270 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRP12270 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRP12270 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRP12270 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPRP12270 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRP12270 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRP12270 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRP12270 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPRP12270 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRP12270 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRP12270 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRP12270 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPRP12270 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRP12270 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRP12270 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRP12270 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRP12270 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRP12270 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRP12270 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPRP12270 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRP12270 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRP12270 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRP12270 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRP12270 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPRP12270 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPRP12270 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRP12270 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRP12270 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRP12270 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRP12270 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRP12270 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRP12270 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRP12270 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRP12270 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRP12270 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRP12270 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRP12270 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPRP12270 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRP12270 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRP12270 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRP12270 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRP12270 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRP12270 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRP12270 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPRP12270 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPRP12270 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRP12270 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRP12270 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPRP12270 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRP12270 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRP12270 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRP12270 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TPRP12270 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRP12270 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRP12270 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRP12270 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPRP12270 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRP12270 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRP12270 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPRP12270 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRP12270 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TPRP12270 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPRP12270 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPRP12270 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRP12270 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRP12270 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRP12270 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRP12270 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRP12270 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms