Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf88P0DMB2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf88P0DMB2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms