Protein–RNA interactions for Protein: P01569

IFNA5, Interferon alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA5P01569 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNA5P01569 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA5P01569 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA5P01569 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA5P01569 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms