Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP3BO95985 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP3BO95985 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOP3BO95985 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms