Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1O95273 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNDBP1O95273 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1O95273 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNDBP1O95273 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms