Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDRT1O95170 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CDRT1O95170 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDRT1O95170 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDRT1O95170 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms