Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB3O75712 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB3O75712 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB3O75712 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB3O75712 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB3O75712 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB3O75712 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB3O75712 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB3O75712 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB3O75712 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB3O75712 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB3O75712 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB3O75712 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB3O75712 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB3O75712 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB3O75712 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB3O75712 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB3O75712 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB3O75712 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB3O75712 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB3O75712 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB3O75712 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB3O75712 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB3O75712 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB3O75712 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB3O75712 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB3O75712 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB3O75712 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB3O75712 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB3O75712 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB3O75712 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB3O75712 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB3O75712 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB3O75712 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB3O75712 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB3O75712 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB3O75712 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB3O75712 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB3O75712 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB3O75712 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB3O75712 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB3O75712 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB3O75712 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB3O75712 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB3O75712 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB3O75712 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB3O75712 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB3O75712 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB3O75712 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB3O75712 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB3O75712 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB3O75712 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB3O75712 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB3O75712 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB3O75712 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB3O75712 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB3O75712 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJB3O75712 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB3O75712 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB3O75712 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB3O75712 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB3O75712 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB3O75712 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB3O75712 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB3O75712 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB3O75712 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB3O75712 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB3O75712 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB3O75712 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB3O75712 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB3O75712 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB3O75712 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB3O75712 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB3O75712 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB3O75712 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB3O75712 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB3O75712 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB3O75712 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB3O75712 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB3O75712 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB3O75712 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB3O75712 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB3O75712 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB3O75712 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB3O75712 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB3O75712 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB3O75712 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB3O75712 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms