Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT3O75175 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNOT3O75175 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT3O75175 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT3O75175 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms