Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS5O43920 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS5O43920 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms